Anthony Cooper is John Lockes biologische vader, toen hij gevonden werd door John lag hij aan de dialyse met de behoefte aan een nieuwe nier. Hij kwam dichter bij John door regelmatig met hem te gaan jagen, en uiteindelijk lichtte hij hem op voor een nier, met gebruik van de inzet van Lockes moeder Emily
Hij verhuisde in een poging om Lock kwijt te raken, die hem aan het achtervolgen was, maar het lukt John om zijn nieuwe huis te vinden. Nadat John werd overtuigd door Helen om niet meer naar zijn huis te gaan, deed Anthony alsof hij dood was, met betrekking tot een schuld van $700.000 voor het oplichten van Jimmy Bane.
Hij vroeg aan John om zijn geld terug te winnen van een privé-kluis en liet hem $200.000 na, als beloofd, voor zijn hulp.
Hij blijkt ook de originele "Sawyer" te zijn, een oplichter die Sawyers moeder, Brooke Ford, verleidde en haar gebruikte om geld te verkrijgen van haar man. Dit spoorde Sawyer (echte naam: James Ford) aan om Sawyers naam te gebruiken en hem op te sporen.
James' partner Hibbs overtuigde Ford dat de echte Sawyer in Sydney woonde onder de naam Frank Duckett, dat spoorde hem aan om naar Australie te gaan en Duckett te vermoorden.
Op het eiland[]
Hij wordt door de Anderen ontvoerd en meegenomen naar het eiland. Ben toont hem aan Locke en vraagt hem Cooper te vermoorden vooraleer hij een van hen mag worden. Locke kan dit niet en laat Sawyer deze klus opknappen.
Aangezien Cooper Sawyers moeder heeft opgelicht vermoordt Sawyer hem nadat hij zijn brief heeft verscheurd.