Rousseau leidt Sayid naar een vreemdeling die ze in de jungle heeft gevangen; Sayid martelt hem om erachter te komen of hij een Ander is; Hurley en Sawyer zoeken een boomkikker in de jungle.
Bernard probeert een enorm SOS-teken op het strand te maken; Kate en Jack gaan de jungle in om een voorstel te doen aan de Anderen, Henry Gale in ruil voor Walt; Michael keert terug.
Eko en Locke vinden het Parel-station; Michael moet zichzelf staande houden als hij Libby langzaam ziet overlijden; de rest van de overlevenden ziet de situatie onder ogen.
Michael, Jack, Hurley, Kate en Sawyer worden gevangen genomen tijdens hun tocht naar het kamp van de Anderen; Locke en Desmond weerhouden Eko ervan op de knop te drukken.
Een machtsspel tussen Jack en "de Anderen" begint, als Juliets toekomst aan een zijden draadje hangt. Ondertussen zetten Kate, Sawyer en Karl hun vlucht voort om "Alcatraz" te verlaten.
John, Sayid en Kate onderzoeken een vreemd gebouw en de geheimzinnige inwoner. Ondertussen doet Sawyer een poging om met een pingpongspel zijn spullen terug te krijgen.
Charlie vertoont vreemd gedrag wanneer Claire een idee heeft hoe iedereen zou kunnen gered worden. Tussen Sayid en John duiken spanningen op wanneer zij op weg zijn om Jack te redden.
Ben probeert een vastberaden Locke te overtuigen zijn vernietigingsplan te stoppen door hem sommige geheimen van het eiland te vertellen; de hereniging van Kate en Jack gaat niet zoals gepland, wanneer zij ontdekt dat hij een overeenkomst met "de Anderen" heeft gemaakt.
Hurley begint Sawyer ervan te verdenken dat hij betrokken is bij een mysterie van het eiland met betrekking tot twee medeoverlevenden, en Sun ontdekt de waarheid over haar vroegere ontvoerpoging door de Anderen.
Kate ontdekt dat iemand van haar lotgenoten haar heeft verraden tegenover De Anderen. Ze staat er alleen voor in de jungle. Hurley waarschuwt Sawyer dat hij zijn egoïstisch gedrag moet veranderen of dat hij anders uitgesloten wordt door de andere overlevenden.
Desmond gaat met Charlie, Hurley en Jin op een tocht door de jungle na een van zijn toekomstvisioenen. Zet hij met opzet het leven van Charlie op het spel? Ondertussen gaat Kate met Sawyer de tent in omdat ze jaloers is op Jack en Juliet.
Nadat ze te weten te zijn gekomen dat zwangere vrouwen van de Anderen overlijden na de geboorte op het Eiland, laat Sun zich onderzoeken door Juliet; Desmond laat een oude bekende hem helpen het leven te redden van een nieuwe, mysterieuze eilandbewoner, die schokkende informatie over vlucht 815 vertelt. Sun komt te weten wie de vader van haar baby is.
Locke is gevlucht van "de Anderen" in een poging Sawyer over te halen hem van een grote vijand af te helpen, die niets dan pijn in hun beide levens heeft gebracht. Ook de andere overlevenden komen schokkende informatie over vlucht 815 te weten.
Terwijl Jack een plan bedenkt om voor eens en voor altijd van de Anderen af te komen, heeft Sayid een plan om iedereen van het eiland te redden. Een gevaarlijke opdracht is voor Charlie weggelegd, wat Desmonds vooruitblik kan laten uitkomen.
Terwijl Jack en de andere losties onderweg zijn naar de radiotoren om deze uit te zetten blijven Sayid, Bernard en Jin achter om de Anderen op te wachten. Ondertussen wordt Charlie gevangen gehouden.
De overlevenden denken dat hun redding nabij is, maar weten niet wat ze moeten denken van Charlies laatste boodschap dat de mensen op de boot niet degenen zijn die ze beweren.
Sayid probeert Locke zo ver te krijgen Charlotte te ruilen met Miles, om zo met de helikopter naar de boot gebracht te worden. Desmond gaat ook mee naar de boot, nadat piloot Frank een foto laat zien van hem en Penelope (zijn vriendin).
Desmond gaat heen en weer tussen het heden en het verleden. Als hij dit blijft ervaren gaat hij dood. Om dit te stoppen moet hij terug in de tijd, zijnde naar Daniel Faraday gaan, die dit op weet te lossen, Hij heeft een constante nodig, iemand die er in het verleden en toekomst nog steeds is.
Juliet herinnert zich haar relatie met Goodwin. Ze krijgt ongewild bezoek van iemand uit haar verleden en krijgt bevel Charlotte en Faraday op te sporen om hen in hun missie te hinderen. Ondertussen doet BenLocke een interessant aanbod.
Juliet voelt zich verplicht onaangenaam nieuws te vertellen aan Jin als Sun dreigt over te lopen naar het kamp van Locke. Ondertussen komen Sayid en Desmond meer te weten over de taak van de bemanning van het schip.
Juliet en Kate moeten samenwerken om Jack te redden als hij erg ziek wordt. Er gaat iets mis als Sawyer, Claire, Miles en Aaron terugkeren naar het strand.
Locke, Hurley, en Ben trekken door het oerwoud op zoek naar de hut van Jacob, terwijl de spanningen hoog oplopen aan boord van de Kahana als Keamy zich klaarmaakt om weer naar het eiland te vertrekken. Flashbacks tonen hoe Locke al zijn leven lang bestemd was voor het eiland.
Terwijl sommige overlevenden het eiland verlaten en op de Kahana toekomen, gaan anderen naar de Orchidee, en sommigen worden door de Anderen gevangen genomen.
